Cortes acoge la segunda colonia de cigüeñas más importante de Navarra, detrás de la de Tudela. La localidad ribera posee 54 nidos con más de 48 parejas, mientras en Tudela son 54 las parejas de estas cicónidas, según el último censo de enero de Gurelur. La mayor concentración de cigüeñas en Cortes se ubica en el edificio de la antigua fábrica harinera.
